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All issues Volume 88 / No 2 (March-April 2008) Dairy Sci. Technol., 88 2 (2008) 217-223 Abstract
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Issue
Dairy Sci. Technol.
Volume 88, Number 2, March-April 2008
Page(s) 217 - 223
DOI https://doi.org/10.1051/dst:2007018
Published online 23 February 2008
Dairy Sci. Technol. 88 (2008) 217-223
DOI: 10.1051/dst:2007018

Detection of B $\kappa $-casein variant (CSN3*B) in Burlina dairy cattle by PCR-TTGE

Federico Pacini1, Annalisa Fellin1, Christian Andrighetto1, Riccardo Dal Zotto2, Massimo De Marchi2, Martino Cassandro2 and Angiolella Lombardi1

1  Veneto Agricoltura - Istituto per la Qualità e le Tecnologie Agroalimentari, Via San Gaetano 74, 36016, Thiene, Vicenza, Italy
2  Department of Animal Science, University of Padova, Viale dell'Università 16, 35020, Legnaro, Padova, Italy

(Received 6 June 2007 - Accepted 10 September 2007 - Published online 23 February 2008)

Abstract - The aim of this study was to develop and optimize a PCR-TTGE method for the detection of B $\kappa $-casein variant (CSN3*B), which is known to play a major role in cheese technology. The effects of the different $\kappa $-casein alleles on the quality and the quantity of cow's milk have been widely reported and the availability of accurate and reliable protocols for the identification of the most common alleles is of great interest in breeding projects. In the present study a new genomic DNA extraction method from milk samples and a PCR-TTGE protocol to quickly identify A and B $\kappa $-casein allelic variants were developed. The DNA extraction method was fast and suitable for DNA amplification, while TTGE proved to be a powerful technique for discrimination of A and B alleles. This method was applied to 197 milk samples derived from Burlina, an Italian dairy cattle breed. CSN3*B allele frequency as detected by PCR-TTGE was 0.368. The development of this PCR-TTGE protocol could be used for future breeding programs to improve milk coagulation ability traits.


Résumé - Détection par PCR-TTGE d'un variant B de caséine $\kappa $ (CSN3*B) dans la race de vaches laitières Burlina
Le but de cette étude était de développer et optimiser une méthode PCR-TTGE pour la détection du variant B de la caséine $\kappa $ (CSN3*B) connu pour son rôle majeur en technologie fromagère. Les effets des différents allèles de caséine $\kappa $ sur la qualité et la quantité de lait ont été largement décrits et la disponibilité de protocoles précis et fiables pour l'identification des allèles les plus communs présente un grand intérêt pour les projets de sélection. Dans la présente étude, une nouvelle méthode d'extraction d'ADN génomique à partir d'échantillons de lait et un protocole PCR-TTGE pour identifier rapidement les variants alléliques de caséine $\kappa $ A et B ont été développés. La méthode d'extraction d'ADN s'est avérée rapide et convenable pour l'amplification d'ADN tandis que la TTGE permettait de discriminer efficacement les allèles A et B. Cette méthode a été appliquée à 197 échantillons de lait de vaches de race italienne Burlina. La fréquence de l'allèle CSN3*B détecté par PCR-TTGE était de 0,368. Le développement de ce protocole PCR-TTGE pourrait être utilisé dans de futurs programmes de sélection pour améliorer le caractère d'aptitude du lait à la coagulation.


Key words: $\kappa $-casein / milk / PCR-TTGE / dairy cattle / Burlina breed

Mots clés : caséine / lait / PCR-TTGE / vache laitière / race Burlina

Corresponding author: angiolella.lombardi@venetoagricoltura.org

© INRA, EDP Sciences 2008